l  오리지널편

(오리지널편이란, 만화책에는 없는 에피소드로, 애니에만 존재하는 에피소드.

원작인 만화책에서는 다루지 않는 에피소드이기에 스토리 전개에는 중요하지 않은 에피소드들이다.)

006화 발렌타인 살인사건

014화 수수께끼의 메시지 저격사건

017화 백화점 강도사건

019화 엘리베이터 살인사건

021화 TV 드라마 로케 살인사건

024화 수수께끼의 미녀 기억상실 사건

025화 거짓 몸값 유괴사건

026화 애견 존 살인사건

029화 컴퓨터 살인사건

030화 알리바이 증언 살인사건

033화 탐정단 서바이벌 사건

036화 월요일 밤 7시 30분 살인사건

037화 선인장꽃 살인사건

041화 우승기 절단사건

044화 홋타 삼형제 살인사건

045화 얼굴팩 살인사건

047화 스포츠클럽 살인사건

051화 골프연습장 살인사건

053화 수수께끼의 흉기 살인사건

055화 열차 트릭 살인사건

056화 청소회사 살인사건

059화 첫 심부름 살인사건

061화 유령선 살인사건 (전편)

062화 유령선 살인사건 (후편)

064화 제3의 지문 살인사건

065화 게와 고래 유괴사건

066화 어두운 길 살인사건

067화 무대 여배우 살인사건

071화 스토커 살인사건

073화 소년 탐정단 조난사건

074화 사신 진나이 살인사건

079화 은행강도 살인사건

080화 방랑화가 살인사건

083화 종합병원 살인사건

087화 학의 은혜 살인사건

088화 드라큘라 별장 살인사건 (전편)

089화 드라큘라 별장 살인사건 (후편)

090화 꽃향기 살인사건

092화 공포의 트래버스 살인사건 (전편)

093화 공포의 트래버스 살인사건 (후편)

094화 유키온나 전설 살인사건

095화 코고로의 데이트 살인사건

097화 이별의 와인 살인사건

106화 스쿠프 사진 살인사건

107화 모구라 성인 수수께끼 사건 (전편)

108화 모구라 성인 수수께끼 사건 (후편)

109화 탐정단 대 추적 사건

110화 요리 교실 살인사건 (전편)

111화 요리 교실 살인사건 (후편)

119화 가면 야이바 살인사건

120화 허니 칵테일 살인사건

123화 기상캐스터 유괴사건

124화 수수께끼의 저격자 살인사건 (전편)

125화 수수께끼의 저격자 살인사건 (후편)

126화 지방 공연 극단 살인사건 (전편)

127화 지방 공연 극단 살인사건 (후편)

135화 사라진 흉기 수색 사건

140화 SOS! 아유미로부터의 메시지

143화 의혹의 천체관측

148화 노면 전차 급정지 사건

149화 유원지 번지점프 사건

150화 자동차 폭발 사건의 진상 (전편)

151화 자동차 폭발 사건의 진상 (후편)

152화 수수께끼의 노인 실종사건

155화 수중의 열쇠 밀실사건

158화 침묵의 순환선

159화 괴기 오층탑 전설 (전편)

160화 괴기 오층탑 전설 (후편)

161화 유수정에 흐르는 살의

165화 소년 탐정단 소실사건

169화 비너스의 키스

175화 4번 살해당한 남자

179화 찻집 트럭 난입사건

180화 붉은 살의의 야상곡 (전편)

181화 붉은 살의의 야상곡 (후편)

182화 대수색 9개의 문

183화 위험한 레시피

184화 저주의 가면은 차갑게 웃는다

185화 살해당한 명탐정 (전편)

186화 살해당한 명탐정 (후편)

187화 어둠 속에 울리는 수수께끼의 총성

196화 보이지 않는 흉기, 란의 첫 추리

197화 슈퍼카의 함정 (전편)

198화 슈퍼카의 함정 (후편)

201화 10번째 승객 (전편)

202화 10번째 승객 (후편)

203화 검은 이카루스의 날개 (전편)

204화 검은 이카루스의 날개 (후편)

207화 너무도 훌륭한 명추리

208화 미궁으로의 입구, 거대 신상의 분노

209화 용신산 전락사건

210화 오색 전설의 호수 저택 (전편)

211화 오색 전설의 호수 저택 (후편)

214화 고전룸의 수수께끼

215화 복수의 만 (전편)

216화 복수의 만 (후편)

225화 장사 번성의 비밀

232화 맨션 전락 사건

235화 밀실의 와인셀러

236화 난키 시라하마 미스터리 투어 (전편)

237화 난키 시라하마 미스터리 투어 (후편)

245화 해바라기관의 총성

248화 위안의 숲의 알리바이

251화 OK 목장의 비극

252화 그림 속의 유괴범

255화 마츠에 타마츠쿠리 연구, 14번의 승부 (전편)

256화 마츠에 타마츠쿠리 연구, 14번의 승부 (후편)

257화 세상의 기묘한 천벌

260화 흔들리는 레스토랑

261화 설야의 공포 전설 (전편)

262화 설야의 공포 전설 (후편)

264화 법정의 대결 키사키 VS 코고로 (전편)

265화 법정의 대결 키사키 VS 코고로 (후편)

273화 퀴즈할머니 실종사건

276화 경찰 수첩 분실사건

281화 작은 목격자들

282화 물이 흐르는 석정의 불가사의 (전편)

283화 물이 흐르는 석정의 불가사의 (후편)

294화 사랑과 결단의 스매쉬 (전편)

295화 사랑과 결단의 스매쉬 (후편)

296화 야카타부네 낚시 쇼크

297화 법정의 대결 II 키사키 VS 쿠죠 (전편)

298화 법정의 대결 II 키사키 VS 쿠죠 (후편)

299화 우정과 살의의 관문해협 (전편)

300화 우정과 살의의 관문해협 (후편)

303화 돌아온 피해자

314화 부서진 울타리의 전망대

315화 햇볕이 드는 장소

318화 행운의 시가케이스 (전편)

319화 행운의 시가케이스 (후편)

320화 둔갑 알리바이 공작술

321화 사라진 유괴 도주차 (전편)

322화 사라진 유괴 도주차 (후편)

328화 생일 와인의 수수께끼

337화 추락사건의 숨은 진실

342화 하우스 텐 보스의 신부

348화 사랑과 유령과 세계유산 (전편)

349화 사랑과 유령과 세계유산 (후편)

352화 낚시 대회의 비극 (전편)

353화 낚시 대회의 비극 (후편)

357화 연인은 봄의 환상

360화 이상한 봄의 장수풍뎅이

363화 도시의 까마귀

364화 싱크로니시티 사건 (전편)

365화 싱크로니시티 사건 (후편)

368화 마녀가 사는 과자의 집

369화 운좋은 남자의 서스펜스

370화 도망쳐 다니는 게임 소프트

373화 맹독 거미의 함정

376화 타임 리미트는 15시!

377화 모모타로 의문 해결 투어 (전편)

378화 모모타로 의문 해결 투어 (후편)

379화 온천 설야 후리소데 사건 (전편)

380화 온천 설야 후리소데 사건 (후편)

384화 타겟은 모리 코고로

388화 사츠마에 취한 모리 코고로 (전편)

389화 사츠마에 취한 모리 코고로 (후편)

392화 수수께끼 같은 신장 차이 20cm

393화 유괴…인 듯한 사건

397화 맵고 쓰고 단 즙

403화 불가사의한 천사의 저택 (전편)

404화 불가사의한 천사의 저택 (후편)

405화 구급차를 부르러 갔던 남자

409화 동시 진행 무대와 유괴 (전편)

410화 동시 진행 무대와 유괴 (후편)

413화 반으로 나뉜 범죄의 수수께끼

414화 푸른새를 쫓는 탐정단

418화 베이커 마을의 다락방 집

419화 야마타노 오로치의 검 (전편)

420화 야마타노 오로치의 검 (후편)

423화 탐정단과 애벌레 4형제

424화 피에로가 보낸 사진 메일

426화 란이 받은 러브레터

433화 코난, 이상한 아이

434화 명견 쿨의 공훈

437화 우에토 아야와 신이치, 4년 전의 약속

439화 그리고 아무도 없다면 좋을 텐데

440화 극한의 CAR-STUNT

441화 최후의 안

442화 철골에 가로막힌 사나이

448화 메구로의 꽁치 사건

450화 트릭 VS 매직 (전편)

451화 트릭 VS 매직 (후편)

452화 금비라관의 유령

456화 내가 사랑했던 미스터리

459화 괴인, 융통성없는 규칙남

461화 사라진 1페이지

468화 연못가의 괴사건

471화 렌트카 제어불능

475화 악운 그랑프리

478화 Real 30 minute

480화 노란 부재증명

483화 사라진 순경

486화 우왕좌왕 마네키네코

489화 법정의 대결 III - 목격자는 검찰관

512화 부서진 점성술

518화 메이지 유신 미스터리 투어 (탐색편)

519화 메이지 유신 미스터리 투어 (해독편)

520화 와인레드의 고발

527화 가면극에 숨긴 악의

536화 사라진 명화의 비밀

539화 어리석은 자에게 주는 유산

540화 모리 코고로의 탐정 폐업의 날 (전편)

541화 모리 코고로의 탐정 폐업의 날 (후편)

544화 불협화음을 만드는 손

547화 범인과의 이틀간 (하루째)

548화 범인과의 이틀간 (이틀째)

553화 The 취조실

554화 황새 미스터리 투어 (란 수색편)

555화 황새 미스터리 투어 (하루나 추적편)

556화 공포의 교차점

562화 무지개 색 유괴

565화 보지 않은 목격자

566화 파트너는 산타씨

567화 노천탕에 내리는 살의

570화 입증 확률 제로의 범죄

577화 반딧불이 밝힌 진실

582화 좀비가 죽은 밤

588화 옥상 농원의 함정

591화 수족관이 있는 집

594화 히로시마 미야지마 7가지 불가사의 투어 (미야지마 편)

595화 히로시마 미야지마 7가지 불가사의 투어 (히로시마 편)

596화 전락의 알리바이

599화 정의의 편

602화 테니스 코트에 잠복한 악마

603화 강령회 W 밀실 사건 (제1의 밀실)

604화 강령회 W 밀실 사건 (제2의 밀실)

605화 강령회 W 밀실 사건 (밀실 개방)

606화 법정의 대결 IV 재판원 고바야시 스미코 (전편)

607화 법정의 대결 IV 재판원 고바야시 스미코 (후편)

629화 프로모션 비디오 촬영 사건 (전편)

630화 프로모션 비디오 촬영 사건 (후편)

631화 꽃시계는 알고 있었다

634화 범행 현장은 굉장히 좁은 가게

635화 위험한 다이어트

636화 세상에서 제일 받고 싶은 수업 사건 (전편)

637화 세상에서 제일 받고 싶은 수업 사건 (후편)

638화 단풍 저택에서 수수께끼를 푼다 (전편)

639화 단풍 저택에서 수수께끼를 푼다 (후편)

640화 8매의 스케치 기억의 여행 (오카야마편)

641화 8매의 스케치 기억의 여행 (쿠라시키편)

658화 초콜릿의 뜨거운 함정

663화 사슴벌레를 쫓아라

664화 명견 쿨의 공훈 2

665화 의혹의 이니셜 K

666화 비오는 밤의 협박자

669화 어두운 탑의 비보 (전편)

670화 어두운 탑의 비보 (후편)

677화 발자국이 없는 모래사장

678화 나가사키 미스터리 극장 (에도막부 말기편)

679화 나가사키 미스터리 극장 (현대편)

680화 선인장 광소곡

686화 시한폭탄을 실은 차

687화 누구에게도 녹지 않는 얼음의 함정

688화 다카기 형사 3천만 줍다

689화 의뢰인으로부터의 메시지

692화 스미다 강 밤 벚꽃놀이 루트 (전편)

693화 스미다 강 밤 벚꽃놀이 루트 (후편)

694화 사라진 전통 화과자

695화 포도원의 장미

696화 화단 털이의 음모

697화 여학원의 창문

698화 설마!? UFO 추락사건

707화 속아 넘어간 명탐정

708화 천천히 떨어진 남자

709화 미확인 충격사건

716화 가면의 저택에 귀신이 춤춘다 (전편)

717화 가면의 저택에 귀신이 춤춘다 (후편)

718화 악마의 회로

719화 프리미엄 티켓 소동기

720화 물과 불의 미스터리 투어 (아소 편)

721화 물과 불의 미스터리 투어 (쿠마모토 편)

726화 행복 메일은 불행을 부른다

729화 다이아몬드와 회화와 대 여배우

730화 너무 완벽했던 피규어

733화 피로연과 두 개의 총성

735화 암호가 들어있는 청첩장

736화 모리 코코로 동상의 비밀

737화 의혹의 산책길

742화 J리거와의 약속

743화 우연은 두 번 겹친다

750화 바다에게 배신당한 남성

753화 셰어 하우스의 사각

757화 자수한 코미디언 (전편)

758화 자수한 코미디언 (후편)

761화 카가 백만석 미스터리 투어 (카나자와 편)

762화 카가 백만석 미스터리 투어 (카가 온천 편)

767화 눈보라 속으로 사라진 연인

768화 하이바라 아이 감금 사건

769화 문제 많은 응급환자

774화 사라진 뭉크의 절규

775화 조종당한 명탐정 (전편)

776화 조종당한 명탐정 (후편)

777화 소년 탐정단 vs 노인 탐정단

778화 천사가 사라진 신기루

784화 직녀 클럽에 잘 오셨습니다

789화 여왕의 일기 예보

790화 베이카 퐁, 출혈 대서비스

791화 타카기 형사, 수갑을 찬 채 도주

794화 보디가드 모리코고로

795화 젊은 사모님이 사라진 비밀

796화 원앙같은 부부의 책략

797화 꿈꾸는 소녀의 어수선한 추리

798화 움직이는 표적

799화 탐정단의 밀실 추리 합전

800화 1억엔을 뒤쫓아라

801화 돗토리 사구 미스터리 투어 (전편)

802화 돗토리 사구 미스터리 투어 (후편)

803화 불조심의 함정

804화 코난과 에비조 가부키의 18번째 미스터리 (전편)

805화 코난과 에비조 가부키의 18번째 미스터리 (후편)

806화 복화술사의 착각 (전편)

807화 복화술사의 착각 (후편)

813화 아무로에게 소리없이 다가오는 그림자

816화 딱하고 상냥한 우주인

817화 사라진 약혼자

818화 코고로, 분노의 대추적 (전편)

819화 코고로, 분노의 대추적 (후편)

820화 대기실의 7명

821화 돈가라절(曇柄寺)이 감춘 비밀

825화 이른 아침의 공원 역전 사건

826화 미녀와 거짓말과 비밀 

829화 신기한 소년

833화 명탐정에게 약점이 있으니

834화 두 번 죽은 남자 (전편)

835화 두 번 죽은 남자 (후편)

855화 사라진 검은 띠의 수수께끼

856화 유명 부부의 비밀

857화 베이커마을 반복 미스터리 (전편)

858화 베이커마을 반복 미스터리 (후편)

859화 어두운 언덕 길

860화 도난 방지 시스템의 함정

876화 기계태엽 목격자

877화 교차하는 운명의 두 사람

880화 탐정단과 유령의 집

883화 그림책에서 튀어나온 폭탄마 (전편)

884화 그림책에서 튀어나온 폭탄마 (후편)