1996. 08. 01 정보화 우수대학 선정(동아일보)

1997. 07. 11 정보화 우수대학 선정(동아일보)

1997. 11. 18 창의적연구진흥사업연구과제 선정 - 항산화단백질연구 (과학기술처)

1998. 07. 01 산학연공동기술개발지역컨소시엄센터 선정(중소기업청, 대전광역시)

1998. 07. 10 정보통신창업지원센터 선정(정보통신부)

1998. 10. 01 창의적연구진흥사업연구과제 선정 - 광혼돈제어연구 (과학기술처)

1998. 12. 01 학사교육개혁 우수대학 선정(교육부)

1999. 04. 01 중소기업 창업지원강좌 대학 지정(중소기업청)

1999. 09. 01 두뇌한국(BK)21 지역대학 육성사업 선정 - 정보통신분야(교육부)

1999. 10. 25 생물의약지역기술혁신센터(TIC) 선정(산업자원부)

2000. 02. 02 1999년도 대학종합평가 최우수 대학원, 우수대학 선정(한국대학교육협의회)

2001. 02. 20 정보통신대학원 시설·장비지원사업 선정(정보통신부)

2001. 06. 26 자연과학연구소 2001년도 이공계 대학연구소 기자재 첨단화 지원사업 선정 (교육인적자원부)

2001. 07. 16 서울캠퍼스지원센터 신설

2001. 08. 18 2001년도 교육개혁 추진 우수대학 선정(교육인적자원부)

2001. 09. 24 제2회 중소기업청 기술혁신대전 우수기관 선정 (국무총리상 수상)

2001. 11. 26 「해외우수 IT교육기관 파견·연수사업 」수행기관 선정 (정보통신부)

2002. 08. 16 2002년도 교육개혁 우수대학 3년연속 선정 (교육인적자원부)

2002. 11. 18 2002년도 지방대학 육성사업 선정(교육인적자원부)

2003년 제4대 총장 정순훈 박사 취임

2004년 산학협력단 설립

2004. 04. 06 2004학년도 ‘지역대학 우수과학자 지원사업’ 신규과제 대학 선정 -과학기술부

2004. 06. 16 ‘지방대학혁신역량강화(NURI)사업’ 선정 (IT공학부/협력대학) -교육인적자원부

2004. 08. 02 지역혁신 특성화 시범사업 선정(원예조경학부/협력대학) -산업자원부

2005년 배재학당 창립120주년 기념 2005아시아대학총장포럼 (제4회) 개최

2005. 02. 07 2005년도 상반기 “CEO 공학교육지원사업” 선정 (세라믹공학과, 토목공학과) - 한국산업기술재단

2005. 03. 21 창의적과제(광혼돈제어연구) 지원 계속과제 선정 -과학기술부

2005. 08. 30 2005 한국어교육 연수프로그램 지원사업선정 (교육인적자원부)

2005. 11. 14 생명유전공학과 지역혁신인력양성사업 2회(2005, 2006~2007) 연속 선정 (산업자원부)

2005. 12. 26 배재대학교 창업보육센터 사업자 신규 지정(중소기업청)

2006. 02. 24 2006년도 NEXT(IT분야 교육경쟁력 강화사업 선정 (정보통신부)

2006. 09. 26 2006 중앙일보 대학평가 국제화부문 10위

2007년도 양자혼돈연구단 도약연구지원사업 과제 선정(한국과학재단)

2007. 07. 01 분자진단상용화사업단 2007년도 지방기술혁신사업 선정(산업기술평가원)

2007. 09. 01 2007년 지능형기술혁신사업단 제안공모과제 수행기관 선정(건설교통부)

2007. 10. 09 세종문화상 교육부분 수상(한국어교육원, 한국어교육연구소)-문화관광부

2008년 2008 중앙일보 대학평가 국제화부문 8위

2008. 02. 25 2008년도 정부초청 외국인 학부장학생 위탁대학 선정

2008. 03 2008년도 NEXT(IT분야 교육경쟁력 강화사업 선정 (정보통신부)

2008. 05. 29 2008 창업보육센터 확장사업 선정(중소기업청)

2008. 07. 14 2008 대통령영어봉사장학생(TaLK-Teach and Learn in Korea) 모집대학 선정

2008. 08. 01 건설교통기술연구개발 스마트하이웨이사업 선정 (한국도로공사)

2009. 07. 15 2009년도 입학사정관제 지원사업(계속대학) 선정

2009. 07. 02 중소기업청 신기술창업집적지역지원사업 선정

2009. 06. 26 중소기업청 2009년 컨설팅대학원지원사업 선정

2010. 10. 05 지식경제부 대전인쇄문화 RIS 지원사업 선정

2011년 제6대 총장 김영호 박사 취임

2011. 10. 13 산업단지 캠퍼스 설치계획 인가(교육과학기술부)

2012년 단과대학명을 배재학당 위인 5명의 이름으로 명명함(아펜젤러대학, 하워드대학, 주시경대학, 김소월대학, 서재필대학)

2012. 02. 09 지역산업인력양성사업 선정(지식경제부)

2012. 04. 24 대전 여성 새일지원본부 지원 기관 선정(여성가족부)

2012. 04. 30 산업단지캠퍼스 조성사업 선정(교육과학기술부)

2013. 05. 18 대전 국제교류센터 수탁기관 선정(대전광역시)

2013. 12. 27 대학기관평가 인증(한국대학평가원)

2013. 12. 27 어린이급식관리지원센터 운영기관 선정(대전광역시 서구청)

2014. 1. 1 2013년도 대학기관평가 인증(한국대학교육협의회 한국대학평가원)

2015. 7. 13 대전인생이모작지원센터 수탁기관 선정(대전광역시)

2015. 8. 31 대전시 서부청소년성문화센터 수탁기관 선정(대전광역시)

2015. 9. 1 건설환경·철도공학과 철도 특성화대학 지원사업 선정(국토교통부)

2016. 2. 24 대학창조일자리센터 선정(고용노동부)

2016. 2. 24 청해진대학 운영기관 선정(고용노동부)

2016. 2. 29 IPP형 일학습병행제 운영 기관 선정(고용노동부)

2016. 4. 1 대덕밸리캠퍼스 IPP사업단 신설

2017. 6. 12 사회맞춤형 산학협력 선도대학(LINC+) 사회맞춤형학과중점형 선정 (교육부)

"의심할 나위도 없이 조선에서 가장 교육적, 도덕적, 지적 영향력을 행사해 왔고 지금도 행사하고 있는 학교는 배재대학이다." 

- '한국과 그 이웃나라들' 388쪽. 이사벨라 비숍(Isabella Bird Bishop)