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유전 정보와 오픈소스 [open source]

QT갤로그로 이동합니다. 2015.06.30 20:38:59
조회 318 추천 4 댓글 4

한국 문화에는 아직 오픈소스 계념이 외국에 비해 많이 떨어저 있는거 같다.


인터넷의 서버중 적어도 65%는 Linux 다.  Mac/iPhone/iPad 쓰는 놈들도 오픈소스 부터 해택보고 있다. 


초재가 만든 KMG9 계산기도 결국은 dienekes가 계발한 DIYDodecad (dodecad_blogspot_com_au)를 조금 수정했을 뿐이다.
Dienekes 블로그나 인터냇에서 공짜로 다운 받을수 있고 아무나 재 수정 하고 공유 할수 있도록 허락 해 주었음.  그 외의 많은 유저들이 DIYDodecad를 이용한 여러 계산기를 배출했다 - harrapaWorld, globe13, MLDP_K23b 등등.  기본 컴퓨터 능력만으로도 자신이다 타인의 유전자 정보를 쉽게 분석할 수 있다.  DIYDodecad 계산기를 돌릴려면 R 소프트웨어가 필요한데 이겄도 오픈소스임.


www_y-str_org 에가면 felix immanuel 이란 분이 여러 프로그램을 만들어 공유했다.  Genetic Genealogy Kit 이란 프로그램 쓸만해 보인다 (하지만 현재론 Geno2.0은 않되는가봄)


하지만 KMG9는 그렇지 않다.  물론 그 계산기 만드는데 많은 수고를 했겠지만 DIYDodecad의 Open source, open access 초점과 어근나 보인다.  초재외에는 KMG9의 문제를 밣혀내기도 고치기도 힘들다.  그냥 초재가 재대로 했겠지 하고 믿을 수 박에 없어보인다. 초보들 한테는 공유하나 마나 겠지만 다른 아마추어들 한테는 오픈소스의 윤리에서 벗어나서 좋을건 없다.



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www_isogg_org/wiki/Y-DNA_tools  (DNA_tools 는 그대로.  점으로 교체하지말것)


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23andme & geno2.0 raw data

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내가 예전에 올린글에 여러 프로그램 및 사이트를 올렸섰은데 링크들이 다 삭제 되었다.  근래 초보들을 위해 기역나는거 몇개만 다시 올려 준다.  '_' 되신 '.' 으로 교환하면됨.


www_y-str_org/2014/07/genetic-genealogy-kit_html


dodecad_blogspot_com


영어가 딸리면 주변 친구들 한테 물어보든.  설명없이 command 만 따라할수 있게 전에 글을 썻는데 삭제 됬던거같다.  내 닉을 찾아보든지.


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y-str (한국/삼성 유전자 검사결과 대부분이 여기 속할거임)

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predictor_ydna_ru


이 분야의 여러 아마추어들 대부분이 유럽인과 유럽 샘플들이라 O 하플로나 하위 측정이 떨어지긴 하지만 아주 기본적인 지식만으로도 혼자서 배울수 있고 얼마 안걸림.  진짜 ㅂㅏㅂ아님 몇 일이 아니라 몇 십분 단위에 배움.




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내가 이런 글을 올린 이유는 유전자 검사에 너무 의미나 거부심을 주지 않키 위해서다.


자신의 궁금증만을 위해서라도 유전검사 안전히 받고 위의 링크나 아님 자신이 직접 찾아보고 배워바라.  그리고 어느정도 성숙해지면 그때 서로 정보교화하고 공개하고 싶으면 하면됨.  내가 이분야에 접한지 2년쯤 됬는대 별것 아님.  특히 (10-17 자리) Y-STR 나 하플로는 개인 정보라고 할 수 없다.  혈액형 수준쯤이야 되겠지.  하플로만보고 한 사람의 면상, 성격, 직업, 주민등록번호, 취양등을 파악할수 없는데 숨기고 아님 거만해함음 아주 어리석은일.  하지만 어리석지 본인이 공계하고 싶지않으면 구지 캐내려할 필요도 이유도 없을 정도의 정보다.


얌전하고 배웠지 싶을만한 유저들도 적지 않은 수가 편견을 갔고 있어보인다.  O3랑 짱개랑 묵는건 지식적으로 틀렸지 너무 감정적으로 대응할 필요가 없다.  내가 보기에 더 큰 문제는 짱개랑 묵이는데 오버하는 것이다.  타인들이 보기에 생김세 하나만으론 짱개나, 한국이나, 쪽바리나, 동남아나 동양인 거기서 거기지, 역큐갤 유저들처럼 짱개들을 다른 인종으로 보는 사람들은 한국과 쪽바리들 뿐이다.  그리고 한국인이랑 중국인을 따른 인종으로볼 정도의 새밀한 유전자 사이로 치면 짱개들은 하나의 인종이 아니지.  한반도인의 수십배되는 짱개조상들이 수천년동안 이주해혼 수가 얼마인대 우리의 많은 조상중에 짱개 한명이 없겠음?  O3 혐오하는 놈들도 아무리 자신이 O3가 아니라해도 현재 한반도의 40-50%의 사람과 같은 조상이 없는 놈이 있겠음?  진짜 2-4천년동안 근친 상간만 한 사람은 아무도 없다고 장담한다.

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