(인터넷에 흔히 떠도는 사진이나 약간 수치가 왜곡됨)

우선 보노보는 침팬지보다 더 작고 가냘픈게 특징임

수컷 보노보와 암컷 보노보의 평균키는 각각 120cm와 110cm로 침팬지 성체 평균인 140~150cm보다 작으며 몸무게 역시 수컷 보노보는 약 44kg, 암컷 보노보는 약 33kg으로 수컷이 40~70kg 혹은 그 이상, 암컷이 30~50kg 정도 나가는 침팬지보다 체급이 낮음

또한 보노보는 침팬지보다 둥근 얼굴형을 띰

보노보는 침팬지보다 귀가 더 작고 안와상융기가 덜 발달되어 있으며, 이빨이 작고 주둥이가 덜 튀어나와 있는데다가 하악이 더 좁은 형태를 띰. 이로 인해 보노보는 침팬지보다 머리가 더 작고 둥근 경향성을 보임. 이런 측면에 대해서 보노보는 인간처럼 유아화했다는 가설도 존재하곤 함

또 보노보는 노년에 접어들어서도 평생동안 검은 털색을 유지하는 편임. 앞서 소개한 보노보 칸지도 2024년 기준 44살의 노인이지만 여전히 검은 털을 뽐내는 모습을 인스타그램에서 확인할 수 있으나 침팬지, 특히 알파 수컷들은 나이가 들수록 실버백과 유사할 정도로 털이 갈색 또는 하얀색으로 변하는 경우가 있음